核甘酸衍生物和寡核酸鏈探針的合成與物性研究

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題名:	核甘酸衍生物和寡核酸鏈探針的合成與物性研究
作者:	靳宗玫
關鍵詞:	2'-位置化學修飾之尿 2'-去氧胞.衍生物核酸三螺旋結構螢旦霈硐鏽麇敦w 固定化探針
日期:	2005
上傳時間:	2009-08-05 10:28:15 (UTC+8)
摘要:	寡核酸鏈能辨識DNA、RNA 及蛋白質的生化功能，使得與寡核酸鏈相關的研究及其潛在的應用層面獲得世人的重視，其中一種辨識核酸的策略便是生成三螺旋結構。核酸三螺旋結構中之核酸鏈同時經過Watson-Crick domain 和Hoogsteen domain 兩次的辨識，因此具有良好的分子辨識專一性，但其在應用上目前仍有許多亟待解決的問題，其中包括提升結構的穩定度及解除鹼基序列辨識的限制。同時，寡核酸鏈探針自身的穩定度（抗酵素降解作用）、檢測靈敏度、及其對目標物的親和性與辨識專一性，都是決定探針效益的重要考量。在本計畫中即分成幾個項目進行研究，期能發展出兼具多項優點之寡核酸鏈探針，並提升核酸三螺旋結構的穩定度。 I. 發展親和性高且抗酵素降解作用之寡核酸鏈探針。在生理酸鹼值帶正電荷之胺類取代基，將藉由化學合成的工具引入尿.酸之2'-位置。數種2'-胺類取代基尿.酸衍生物將在本計劃中進行合成，並嵌入寡核酸鏈進行物理性質測量。 II. 合成鹼基N4-位置具延伸6-胺基比啶環之2'-去氧胞.酸衍生物（pC）以解除鹼基序列辨識的限制。pC 對CG 有較高的親和性，進而延伸Hoogsteen 核酸鏈與雙螺旋作用的範圍。將合成2'-去氧胞.酸衍生物pC 並嵌入結構自由度較高之髮夾式寡核酸鏈探針中進行物性研究。 III. 設計與合成螢光寡核酸鏈探針。螢光探針5'-Fluorescein-d-(TC)nT4(CT)n-Dabcyl 預期可降低定量PCR 探針所遇到的螢光背景值干擾問題，進而提升檢測靈敏度。2-胺基嘌呤核.酸能避免多環芳香螢光標誌對生物分子交互作用可能造成的干擾，將進行 2-胺基嘌呤核.酸的化學合成並嵌入探針，應用在DNA-protein interaction 的研究。 IV. 發展廣用固定化寡核酸鏈探針策略。廣用寡核酸鏈探針先固定於載體上，再引入專一性探針進行生物分子辨識或生化反應。將研發寡核酸鏈探針固定於載體上的化學合成方法，及廣用固定化寡核酸鏈探針策略的操作條件。 V. 髮夾式寡核酸鏈探針的研究－反基因和反意義試劑的研發。核酸序列5'-d-(TC)n 和 5'-d-(AG)n 為基因中常出現的序列，將進行研究系列探針5'-d-(AG)nT4(CT)n 和 5'-d-(TC)nT4(CT)n 與目標核酸鏈（雙螺旋DNA 或單股RNA）相互作用的情形，探討各實驗因子對其親和性、辨識專一性的影響。
顯示於類別:	[化學系所] 研究計畫

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